Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM179Q6ZVK1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM179Q6ZVK1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM179Q6ZVK1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms