Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
LRRC9Q6ZRR7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
LRRC9Q6ZRR7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRC9Q6ZRR7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms