Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARA5Q6ZMJ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms