Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK4Q6UW60 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK4Q6UW60 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms