Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S3Q6QNY0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BLOC1S3Q6QNY0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BLOC1S3Q6QNY0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms