Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC11Q6PKC3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC11Q6PKC3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms