Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL35Q6PF15 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL35Q6PF15 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL35Q6PF15 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms