Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGB2Q6NT52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGB2Q6NT52 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms