Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL6Q6ICC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTL6Q6ICC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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