Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM68Q6AZZ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms