Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM198Q66K66 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM198Q66K66 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms