Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA1Q5Y7H0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms