Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRIP1Q5VSL9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRIP1Q5VSL9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRIP1Q5VSL9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRIP1Q5VSL9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRIP1Q5VSL9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRIP1Q5VSL9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRIP1Q5VSL9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRIP1Q5VSL9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRIP1Q5VSL9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRIP1Q5VSL9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRIP1Q5VSL9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms