Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CCDC18Q5T9S5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC18Q5T9S5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC18Q5T9S5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC18Q5T9S5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms