Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
UBXN11Q5T124 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBXN11Q5T124 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN11Q5T124 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms