Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PITRM1Q5JRX3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PITRM1Q5JRX3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms