Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO2Q562F6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGO2Q562F6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SGO2Q562F6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGO2Q562F6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms