Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPDYE2Q495Y8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPDYE2Q495Y8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPDYE2Q495Y8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPDYE2Q495Y8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms