Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFAP100Q494V2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP100Q494V2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP100Q494V2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP100Q494V2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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