Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC153Q494R4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC153Q494R4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms