Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETFDHQ16134 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ETFDHQ16134 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ETFDHQ16134 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFDHQ16134 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ETFDHQ16134 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFDHQ16134 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ETFDHQ16134 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFDHQ16134 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFDHQ16134 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ETFDHQ16134 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFDHQ16134 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFDHQ16134 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ETFDHQ16134 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFDHQ16134 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ETFDHQ16134 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ETFDHQ16134 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFDHQ16134 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFDHQ16134 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFDHQ16134 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFDHQ16134 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFDHQ16134 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFDHQ16134 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ETFDHQ16134 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ETFDHQ16134 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFDHQ16134 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFDHQ16134 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ETFDHQ16134 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFDHQ16134 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFDHQ16134 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFDHQ16134 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFDHQ16134 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ETFDHQ16134 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFDHQ16134 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFDHQ16134 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ETFDHQ16134 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETFDHQ16134 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFDHQ16134 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETFDHQ16134 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFDHQ16134 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFDHQ16134 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFDHQ16134 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFDHQ16134 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFDHQ16134 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ETFDHQ16134 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ETFDHQ16134 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFDHQ16134 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFDHQ16134 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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