Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB30Q15771 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB30Q15771 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB30Q15771 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB30Q15771 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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