Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
EEA1Q15075 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
EEA1Q15075 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
EEA1Q15075 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
EEA1Q15075 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
EEA1Q15075 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
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