Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAMK2BQ13554 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2BQ13554 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAMK2BQ13554 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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