Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC3Q13507 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRPC3Q13507 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC3Q13507 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPC3Q13507 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPC3Q13507 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPC3Q13507 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC3Q13507 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC3Q13507 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC3Q13507 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC3Q13507 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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