Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SF3B2Q13435 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SF3B2Q13435 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SF3B2Q13435 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
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