Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC40.04■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC40.03■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.01■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
GRIN2BQ13224 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.92■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
GRIN2BQ13224 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
GRIN2BQ13224 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
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