Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKAA1Q13131 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAA1Q13131 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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