Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF2Q12933 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF2Q12933 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms