Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN13Q12923 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN13Q12923 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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