Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIPPLY1Q0D2K3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RIPPLY1Q0D2K3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIPPLY1Q0D2K3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms