Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms