Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTN3Q08043 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN3Q08043 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms