Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN1Q05586 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN1Q05586 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN1Q05586 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms