Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A11Q02978 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A11Q02978 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms