Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2BQ00403 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2BQ00403 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2BQ00403 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2BQ00403 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2BQ00403 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms