Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2IP63279 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms