Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VBP1P61758 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VBP1P61758 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VBP1P61758 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VBP1P61758 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VBP1P61758 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VBP1P61758 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VBP1P61758 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VBP1P61758 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VBP1P61758 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VBP1P61758 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VBP1P61758 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VBP1P61758 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VBP1P61758 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VBP1P61758 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VBP1P61758 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VBP1P61758 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VBP1P61758 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VBP1P61758 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VBP1P61758 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VBP1P61758 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VBP1P61758 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VBP1P61758 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VBP1P61758 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VBP1P61758 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VBP1P61758 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VBP1P61758 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VBP1P61758 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VBP1P61758 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VBP1P61758 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VBP1P61758 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VBP1P61758 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VBP1P61758 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VBP1P61758 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VBP1P61758 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VBP1P61758 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VBP1P61758 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VBP1P61758 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VBP1P61758 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VBP1P61758 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VBP1P61758 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VBP1P61758 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VBP1P61758 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VBP1P61758 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VBP1P61758 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VBP1P61758 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VBP1P61758 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VBP1P61758 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VBP1P61758 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VBP1P61758 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VBP1P61758 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VBP1P61758 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VBP1P61758 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VBP1P61758 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VBP1P61758 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VBP1P61758 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VBP1P61758 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VBP1P61758 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VBP1P61758 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VBP1P61758 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VBP1P61758 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VBP1P61758 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VBP1P61758 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VBP1P61758 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VBP1P61758 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms