Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTR3P61158 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms