Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBASH3AP57075 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBASH3AP57075 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms