Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MFAP3P55082 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFAP3P55082 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms