Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLTPP55058 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLTPP55058 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLTPP55058 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLTPP55058 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLTPP55058 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLTPP55058 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLTPP55058 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLTPP55058 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PLTPP55058 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLTPP55058 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLTPP55058 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLTPP55058 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLTPP55058 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLTPP55058 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PLTPP55058 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLTPP55058 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLTPP55058 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLTPP55058 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLTPP55058 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLTPP55058 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLTPP55058 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLTPP55058 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLTPP55058 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLTPP55058 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLTPP55058 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLTPP55058 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLTPP55058 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLTPP55058 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLTPP55058 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLTPP55058 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PLTPP55058 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLTPP55058 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PLTPP55058 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLTPP55058 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PLTPP55058 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLTPP55058 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLTPP55058 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLTPP55058 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLTPP55058 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLTPP55058 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLTPP55058 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLTPP55058 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLTPP55058 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLTPP55058 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLTPP55058 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLTPP55058 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLTPP55058 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLTPP55058 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLTPP55058 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLTPP55058 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLTPP55058 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLTPP55058 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLTPP55058 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLTPP55058 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLTPP55058 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLTPP55058 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLTPP55058 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLTPP55058 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLTPP55058 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLTPP55058 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLTPP55058 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLTPP55058 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLTPP55058 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLTPP55058 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLTPP55058 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PLTPP55058 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLTPP55058 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLTPP55058 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLTPP55058 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLTPP55058 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLTPP55058 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLTPP55058 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLTPP55058 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLTPP55058 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLTPP55058 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLTPP55058 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLTPP55058 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLTPP55058 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms