Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H2P55055 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms