Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRISP1P54107 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP1P54107 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP1P54107 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP1P54107 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP1P54107 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP1P54107 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP1P54107 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRISP1P54107 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRISP1P54107 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms