Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMTNP53814 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMTNP53814 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMTNP53814 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMTNP53814 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMTNP53814 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMTNP53814 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMTNP53814 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMTNP53814 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMTNP53814 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMTNP53814 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMTNP53814 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMTNP53814 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMTNP53814 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMTNP53814 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMTNP53814 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMTNP53814 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMTNP53814 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMTNP53814 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMTNP53814 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMTNP53814 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMTNP53814 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMTNP53814 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMTNP53814 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMTNP53814 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMTNP53814 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMTNP53814 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMTNP53814 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMTNP53814 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMTNP53814 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMTNP53814 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMTNP53814 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMTNP53814 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMTNP53814 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMTNP53814 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMTNP53814 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMTNP53814 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMTNP53814 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMTNP53814 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMTNP53814 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMTNP53814 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMTNP53814 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMTNP53814 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMTNP53814 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMTNP53814 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMTNP53814 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMTNP53814 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMTNP53814 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMTNP53814 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMTNP53814 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMTNP53814 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMTNP53814 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMTNP53814 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMTNP53814 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMTNP53814 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMTNP53814 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMTNP53814 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMTNP53814 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMTNP53814 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMTNP53814 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMTNP53814 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMTNP53814 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMTNP53814 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMTNP53814 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMTNP53814 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMTNP53814 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMTNP53814 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMTNP53814 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMTNP53814 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMTNP53814 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMTNP53814 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMTNP53814 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMTNP53814 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMTNP53814 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMTNP53814 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMTNP53814 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMTNP53814 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMTNP53814 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMTNP53814 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMTNP53814 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms