Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACLYP53396 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACLYP53396 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACLYP53396 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACLYP53396 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ACLYP53396 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ACLYP53396 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACLYP53396 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACLYP53396 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACLYP53396 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACLYP53396 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACLYP53396 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACLYP53396 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACLYP53396 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACLYP53396 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACLYP53396 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACLYP53396 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACLYP53396 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACLYP53396 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACLYP53396 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ACLYP53396 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACLYP53396 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACLYP53396 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACLYP53396 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ACLYP53396 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACLYP53396 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACLYP53396 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACLYP53396 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACLYP53396 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACLYP53396 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ACLYP53396 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACLYP53396 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACLYP53396 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACLYP53396 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACLYP53396 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACLYP53396 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACLYP53396 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ACLYP53396 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACLYP53396 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACLYP53396 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACLYP53396 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACLYP53396 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACLYP53396 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACLYP53396 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACLYP53396 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ACLYP53396 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACLYP53396 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACLYP53396 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACLYP53396 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACLYP53396 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACLYP53396 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACLYP53396 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACLYP53396 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACLYP53396 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACLYP53396 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ACLYP53396 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ACLYP53396 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ACLYP53396 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ACLYP53396 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACLYP53396 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACLYP53396 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACLYP53396 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACLYP53396 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACLYP53396 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ACLYP53396 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACLYP53396 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACLYP53396 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACLYP53396 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACLYP53396 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ACLYP53396 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACLYP53396 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACLYP53396 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACLYP53396 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACLYP53396 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACLYP53396 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACLYP53396 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACLYP53396 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACLYP53396 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACLYP53396 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACLYP53396 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACLYP53396 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACLYP53396 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ACLYP53396 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACLYP53396 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACLYP53396 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACLYP53396 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACLYP53396 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACLYP53396 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ACLYP53396 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACLYP53396 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms