Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LBX1P52954 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LBX1P52954 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LBX1P52954 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LBX1P52954 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LBX1P52954 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LBX1P52954 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LBX1P52954 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LBX1P52954 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LBX1P52954 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LBX1P52954 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LBX1P52954 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LBX1P52954 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LBX1P52954 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LBX1P52954 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LBX1P52954 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LBX1P52954 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LBX1P52954 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LBX1P52954 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LBX1P52954 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LBX1P52954 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LBX1P52954 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LBX1P52954 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LBX1P52954 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LBX1P52954 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LBX1P52954 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LBX1P52954 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LBX1P52954 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LBX1P52954 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LBX1P52954 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LBX1P52954 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LBX1P52954 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LBX1P52954 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LBX1P52954 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LBX1P52954 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LBX1P52954 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LBX1P52954 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LBX1P52954 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LBX1P52954 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LBX1P52954 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LBX1P52954 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LBX1P52954 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LBX1P52954 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LBX1P52954 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LBX1P52954 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LBX1P52954 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LBX1P52954 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LBX1P52954 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LBX1P52954 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LBX1P52954 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LBX1P52954 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LBX1P52954 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LBX1P52954 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LBX1P52954 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LBX1P52954 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LBX1P52954 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LBX1P52954 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LBX1P52954 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LBX1P52954 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LBX1P52954 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LBX1P52954 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LBX1P52954 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LBX1P52954 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LBX1P52954 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LBX1P52954 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LBX1P52954 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LBX1P52954 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LBX1P52954 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LBX1P52954 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LBX1P52954 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LBX1P52954 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LBX1P52954 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LBX1P52954 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LBX1P52954 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LBX1P52954 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LBX1P52954 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LBX1P52954 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LBX1P52954 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LBX1P52954 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LBX1P52954 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LBX1P52954 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LBX1P52954 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LBX1P52954 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LBX1P52954 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LBX1P52954 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LBX1P52954 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LBX1P52954 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LBX1P52954 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LBX1P52954 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LBX1P52954 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LBX1P52954 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LBX1P52954 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LBX1P52954 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LBX1P52954 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LBX1P52954 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LBX1P52954 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LBX1P52954 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LBX1P52954 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LBX1P52954 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LBX1P52954 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms