Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HK3P52790 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HK3P52790 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HK3P52790 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HK3P52790 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HK3P52790 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HK3P52790 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HK3P52790 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HK3P52790 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HK3P52790 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HK3P52790 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HK3P52790 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HK3P52790 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HK3P52790 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HK3P52790 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HK3P52790 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HK3P52790 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HK3P52790 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HK3P52790 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HK3P52790 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HK3P52790 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HK3P52790 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HK3P52790 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HK3P52790 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HK3P52790 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HK3P52790 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HK3P52790 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HK3P52790 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HK3P52790 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HK3P52790 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HK3P52790 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HK3P52790 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HK3P52790 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HK3P52790 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HK3P52790 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HK3P52790 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HK3P52790 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HK3P52790 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HK3P52790 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HK3P52790 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HK3P52790 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HK3P52790 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HK3P52790 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HK3P52790 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HK3P52790 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HK3P52790 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HK3P52790 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HK3P52790 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HK3P52790 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HK3P52790 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HK3P52790 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HK3P52790 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HK3P52790 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HK3P52790 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HK3P52790 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HK3P52790 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HK3P52790 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HK3P52790 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HK3P52790 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HK3P52790 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HK3P52790 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HK3P52790 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HK3P52790 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HK3P52790 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HK3P52790 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms