Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR1P51861 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR1P51861 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR1P51861 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR1P51861 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR1P51861 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR1P51861 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR1P51861 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR1P51861 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR1P51861 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR1P51861 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR1P51861 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR1P51861 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR1P51861 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR1P51861 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDR1P51861 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDR1P51861 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDR1P51861 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDR1P51861 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDR1P51861 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR1P51861 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR1P51861 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR1P51861 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR1P51861 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR1P51861 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR1P51861 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR1P51861 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR1P51861 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR1P51861 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR1P51861 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR1P51861 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR1P51861 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR1P51861 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR1P51861 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR1P51861 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR1P51861 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR1P51861 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR1P51861 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR1P51861 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR1P51861 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR1P51861 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR1P51861 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR1P51861 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR1P51861 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR1P51861 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR1P51861 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR1P51861 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR1P51861 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR1P51861 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR1P51861 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR1P51861 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR1P51861 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR1P51861 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR1P51861 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR1P51861 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDR1P51861 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDR1P51861 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDR1P51861 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDR1P51861 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDR1P51861 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDR1P51861 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDR1P51861 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDR1P51861 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDR1P51861 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDR1P51861 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDR1P51861 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDR1P51861 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDR1P51861 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDR1P51861 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR1P51861 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR1P51861 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR1P51861 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR1P51861 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR1P51861 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR1P51861 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR1P51861 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR1P51861 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR1P51861 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDR1P51861 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDR1P51861 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDR1P51861 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDR1P51861 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDR1P51861 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR1P51861 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR1P51861 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR1P51861 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR1P51861 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR1P51861 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR1P51861 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR1P51861 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR1P51861 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDR1P51861 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDR1P51861 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDR1P51861 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDR1P51861 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDR1P51861 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDR1P51861 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDR1P51861 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDR1P51861 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDR1P51861 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms