Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR5P51681 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR5P51681 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR5P51681 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR5P51681 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR5P51681 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR5P51681 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR5P51681 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR5P51681 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR5P51681 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR5P51681 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR5P51681 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR5P51681 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR5P51681 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR5P51681 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR5P51681 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR5P51681 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR5P51681 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR5P51681 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR5P51681 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR5P51681 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR5P51681 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR5P51681 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR5P51681 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR5P51681 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR5P51681 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR5P51681 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR5P51681 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR5P51681 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR5P51681 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR5P51681 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR5P51681 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR5P51681 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR5P51681 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR5P51681 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR5P51681 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR5P51681 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR5P51681 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR5P51681 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR5P51681 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR5P51681 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR5P51681 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR5P51681 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR5P51681 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR5P51681 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR5P51681 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR5P51681 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR5P51681 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR5P51681 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR5P51681 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR5P51681 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR5P51681 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR5P51681 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR5P51681 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR5P51681 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR5P51681 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR5P51681 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR5P51681 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR5P51681 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR5P51681 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCR5P51681 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCR5P51681 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR5P51681 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR5P51681 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR5P51681 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR5P51681 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR5P51681 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR5P51681 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR5P51681 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR5P51681 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR5P51681 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR5P51681 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR5P51681 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR5P51681 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR5P51681 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR5P51681 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR5P51681 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR5P51681 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR5P51681 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR5P51681 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR5P51681 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR5P51681 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR5P51681 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR5P51681 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR5P51681 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR5P51681 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR5P51681 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR5P51681 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR5P51681 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR5P51681 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCR5P51681 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR5P51681 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR5P51681 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR5P51681 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR5P51681 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR5P51681 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR5P51681 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR5P51681 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR5P51681 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR5P51681 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms