Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCNN1GP51170 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1GP51170 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms